Комплектации лабораторий
ПЦР-лаборатория должна быть разделена на три зоны — по числу технологических операций:
- зона подготовки реакционной смеси («чистая» зона);
- зона пробоподготовки;
- зона детекции.
Все три зоны должны быть изолированными комнатами, снабженными предбоксниками. Полезно иметь устройство фильтрации воздуха.
При наличии специальных боксов первую и вторую зоны допускается объединить; расположение зоны детекции зависит от того, какой из методов детекции применяется. Если используется метод, при котором необходимо открывать пробирку с продуктами амплификации (электрофорез, гибридизационный анализ) то зона детекци должна размещаться как можно дальше от двух других зон (другой этаж, другое здание) и иметь не связанную с другими зонами систему вентиляции. Это является принципиальным требованием при организации ПЦР-лаборатории.
Кроме того, желательно предусмотреть отдельные помещения для переодевания и хранения верхней одежды, приема пищи, складское помещение для лабораторных материалов.
Все производственные комнаты должны быть снабжены коротковолновыми ультрафиолетовыми лампами.
Перемещение пробирок, штативов и пр. должно производиться только в направлении из «чистой» зоны в зоны пробоподготовки и детекции.
Клинический материал, поступивший в лабораторию, должен быть как можно быстрее обработан (выделены ДНК и РНК) в комнате пробоподготовки. В эту же комнату должны поступать пробирки с реакционной смесью из «чистой» зоны для внесения в них препаратов ДНК. После этого пробирки помещают в амплификатор и, по окончании термоциклирования, не открывая крышек, переносят в зону детекции. Все операции при использовании метода гель-электрофореза или гибридизации для детекции (пробоподготовка, подготовка реакционной смеси, электрофорез или гибридизация) должны выполнять разные люди.
Для обработки клинических образцов должны быть установлены ПЦР-боксы, обеспечивающие безопасность персонала при работе с инфекционным материалом и предусматривающие длительную экспозицию внутренних поверхностей ультрафиолетовым светом.
Подготовку реакционной смеси следует проводить в ПЦР-боксе, снабженном электрическими розетками, лампами дневного и ультрафиолетового света.
Запрещается внесение пробирок с положительными контролями или клиническими образцами как до, так и после обработки, в комнату подготовки реакционной смеси («чистую» зону).
Все производственные комнаты должны быть снабжены необходимым оборудованием и расходными материалами, в том числе халатами и сменной обувью, закрепленными за соответствующими помещениями.
При детекции методом гибридизации в процессе амплификации нет необходимости открывать пробирку после проведения ПЦР, таким образом, устраняется опасность попадания во внешнюю среду большого количества ампликонов, а следовательно, значительно снижается вероятность контаминации. В этом случае не требуется отдельного помещения для этапа детекции, детектирующие приборы размещают в смежных с чистой зоной помещениях, и все операции могут быть выполнены одним сотрудником. Такой метод детекции реализован в технологии «Real-Time» и «FLASH».